K běžnému využívání doporučujeme používat jen protokol IMAP, který pracuje s e-maily přímo na serveru. To je mnohem výhodnější ve chvíli, kdy přistupujete ke schránce z více zařízení, např. počítače i mobilu. Možná tedy chcete skočit raději na nastavení přístupu k e-mailu přes IMAP.

Protokol POP3 stahuje zprávy z poštovní schránky a pracuje s nimi přímo v zařízení, ze serveru je smaže buď rovnou nebo po nastavené době. Přečtená či smazaná pošta je pak různá na serveru a ve vašem klientovi.

Nastavení přístupu pomocí POP3 je vhodné ve speciálních případech. Například při exportu zpráv do jiné schránky.

Nastavení protokolu POP3 pro e-mailové klienty